2024年10月，北京大学医学部与深圳华大基因科技有限公司（以下简称“华大”）签署合作协议，携手共同建立生命大数据联合实验室。
12月16日，在北大医学第五届健康产业论坛暨北京密云生命健康产业发展大会上，北京大学医学部副主任肖渊、北京大学公共卫生学院副院长任涛向华大颁发“北大医学产学研合作伙伴感谢状”，以感谢其为北大医学产学研深度融合协同发展所付出的努力和贡献。
12月27日，在北京市投资促进服务中心党组书记孙尧，北京市卫健委一级巡视员潘苏彦，海淀区副区长林航，北京市科学技术委员会、中关村科技园区管理委员会二级巡视员李志磊，CKB项目负责人、北京大学公众健康与重大疫情防控战略研究中心主任李立明，以及华大集团执行董事、华大生命科学研究院院长徐讯，华大集团董事、副总裁李斌，华大集团区域总经理刘世亮的见证下，双方在华大全球创新中心启动仪式暨科技成果汇报会上举行了战略合作签约仪式。北京大学医学部副主任肖渊，华大集团董事、执行副总裁杨爽代表双方签约。
华大是全球领先的生命科学前沿机构，以“产学研”一体化的发展模式引领基因组学的创新发展，将前沿的多组学科研成果应用于医学健康、资源保存等领域，也为精准医疗、精准健康等关系国计民生的实际需求提供自主可控的先进设备、技术保障和解决方案。
华大先进的基因测序技术为CKB项目提供了重要的技术支撑，是项目的长期合作伙伴。2012年起，华大承担了CKB项目DNA提取和基因芯片检测工作，为项目基因研究提供了关键支持。此后，华大陆续承担了项目部分生物样本全基因组测序（WGS）、项目唾液和粪便样本宏基因组检测工作。2024年，项目与华大开展战略合作，对全体研究对象的样本开展WGS测序。该项工作将生物样本转化为极具价值的基因组学数据，通过整合项目丰富多样的数据资源，将为后续深入研究疾病的发病机制和遗传基础、开展疾病风险预测等提供强有力的数据支撑。
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